隨著歷史的變遷，城市化進展的加速，歷史文化名城的保護與建設(shè)成了一對不可避免的矛盾，而為協(xié)調(diào)兩者的矛盾，新的南京總體規(guī)劃修編在“保護”的法律層次和嚴格等級上，出臺了三個級別的分級控制體系：指定保護、登錄保護、規(guī)劃控制。

　　劃定三大“歷史城區(qū)”

　　南京歷史遺存豐富，但人們從城市的表象中卻很難一下感受到“歷史的厚度”。這是名城保護的一個尷尬。原因是越來越多的高樓大廈遮蔽、“沖淡”了歷史風貌區(qū)。為此，南京總規(guī)首次劃出三片大的歷史城區(qū)：城南、明故宮、鼓樓-清涼山，這3個片區(qū)內(nèi)禁建高層。

　　南京市規(guī)劃設(shè)計研究院有限責任公司教授級高工童本勤說，這三大片區(qū)面積均超過6平方公里，區(qū)域新增建筑高度擬控制在24米以下，且嚴格控制新、改、擴建項目，從更大空間范圍內(nèi)保護古都的背景機理。其中城南歷史片區(qū)東、西至護城河，南至緯七路，建筑高度整體控制在18米以下，長虹路以南的近城墻區(qū)域，建筑控高12米，且嚴格控制大流量、大尺度道路。明故宮御道街道路兩側(cè)外40米范圍內(nèi)及明御河圍合范圍內(nèi)，控高18米。鼓樓—清涼山歷史城區(qū)，保護大學、大院和頤和路歷史街區(qū)，新建和改建項目要與民國建筑和山水環(huán)境相協(xié)調(diào)。

　　除了三大“歷史城區(qū)”保護外，還確定了10大片文化街區(qū)、文物古跡、非物質(zhì)文化遺產(chǎn)的保護規(guī)劃。

　　出臺三個保護控制方式

　　南京現(xiàn)代服務(wù)業(yè)尚在老城，老城改造難免碰掉歷史的“壇壇罐罐”。新的總規(guī)草案顯示，南京在歷史文化名城“保護”的制度體系上，出臺了三個保護控制方式。分別是：指定保護、登錄保護、規(guī)劃控制。

　　所謂“指定保護”即對文物保護單位、歷史文化街區(qū)、歷史文化名鎮(zhèn)、歷史文化名村進行指定保護。對指定保護的對象強調(diào)維護其“真實性”和“完整性”嚴格按照相關(guān)法律法規(guī)進行“剛性”保護。南京500多處市、縣以上文物建筑，以及頤和路、梅園新村等10片歷史街區(qū)，屬于指定保護范圍。

　　“登錄保護”更加強調(diào)的是“彈性保護”，南京近500處民國建筑和13片歷史風貌區(qū)即屬于這一類保護范圍，指法律法規(guī)沒有明確規(guī)定，但對于南京又有重要意義的歷史文化資源，將列入南京歷史文化資源保護名錄，進行登錄保護。

　　至于“規(guī)劃控制”保護，是指那些未能達到指定保護和登錄保護標準的其他歷史文化資源，作為規(guī)劃控制對象，由規(guī)劃行政主管部門納入規(guī)劃管理信息系統(tǒng)進行控制，結(jié)合城市更新改造，以各種手段進行展示和利用，不得隨意滅失。通過各種城市設(shè)計和建筑手法保護和延續(xù)其歷史價值和特色。