RNA操作是目前研究的熱點之一。要實現精確的RNA操作,需要特異地識別靶向目標RNA分子并對其進行剪切。但到目前為止,這類序列特異的RNA內切酶在自然界中還沒有被發(fā)現。因此,尋找一類序列特異的RNA內切酶顯得尤為重要。
中國科學院植物研究所盧從明研究組通過一系列生化實驗發(fā)現,PPR-SMR蛋白家族成員SOT1能夠在體外特異且高效地剪切其RNA底物。通過生化、分子與遺傳等分析,研究人員進一步發(fā)現SOT1的PPR結構域能夠特異識別葉綠體23S-4.5S核糖體RNA前體5′末端一段含有13個核苷酸的序列,并通過其SMR結構域剪切了該識別序列的下游序列,從而參與了擬南芥葉綠體23S-4.5S核糖體RNA前體的成熟。研究人員還通過突變SOT1蛋白的PPR結構域的特定位點,使突變的蛋白能夠識別并剪切預期的RNA底物而不再識別并剪切原來的RNA底物。這一結果首次證明SOT1具有序列特異的RNA內切酶活性,且能夠被人工改造用來識別并剪切預期的RNA底物,可以作為一種RNA操作工具而具有廣泛的應用前景。
該研究結果于2月6日在線發(fā)表于《美國科學院院刊》(PNAS)上。盧從明研究組博士研究生周穩(wěn)和副研究員盧慶陶為該論文共同第一作者。該研究工作得到科技部“973”項目、中科院前沿科學重點研究項目和B類戰(zhàn)略性先導科技專項的資助。
SOT1可程控地識別并剪切不同RNA底物
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